1989 年春，台湾地区星云大师率团回大陆探亲弘法，当时有八个学术团体邀请星云法师讲演，中国佛教协会委派净慧法师全程陪同。

2002 年 2 月 23 日，台湾地区佛教界迎请陕西扶风法门寺地宫佛指舍利到台湾地区巡瞻供奉三十七天。佛指舍利莅台，影响空前，前往虔诚参拜的信众达四百多万人次。3 月 25 日，净慧长老率佛指舍利迎归团前往宝岛。3 月 31 日，大陆迎归团团长净慧法师和台湾恭送团团长星云法师及众多海峡两岸佛子护卫佛指舍利飞抵西安。

2006年12月5日，净慧长老与本焕长老、星云大师、传印长老等出席弘法寺传戒法会。

2009年3月28日，第二届世界佛教论坛在江苏无锡灵山梵宫开幕，净慧长老、星云大师、觉光长老、健钊长老共同出席“菩提树下——两岸四地佛教界交流里程记忆”电视论坛。